説明
El género Rubus está conformado aproximadamente 700 especies que incluyen moras y frambuesas. En el Ecuador el cultivo de estas especies se centra en la mora de castilla (Rubus glaucus), siendo uno de los frutales con uno de los mayores potenciales agronómicos y comerciales en el Ecuador. Las principales investigaciones sobre el género se han centrado en estudios fisicoquímicos, manejo agrícola y en menor medida a la caracterización molecular. Por tal razón, este trabajo aportó con datos de variabilidad genética de Rubus glaucus en la serranía del Ecuador. El estudio se inició con la extracción de ADN y con la selección de marcadores utiles para el genotipaje de R. glaucus.
データ レコード
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バージョン
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引用方法
研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:
MORILLO E, BUITRON J, FEICAN C, BUITRÓN J (2024). Análisis de la variabilidad genética de moras de valles andinos de Ecuador. Version 1.0. Ninguna organización. Occurrence dataset. https://patrimonio.ambiente.gob.ec/iptmae_permisos/resource?r=andivalles_mora&v=1.0
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.
GBIF登録
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キーワード
mora de castilla; Rubus glaucus; marcadores moleculares; variabilidad genética; Ecuador
連絡先
- 最初のデータ採集者
- RESPONSABLE TÉCNICO
https://orcid.org/orcid.org/0000-0002-6875-6002
- 最初のデータ採集者
- INVESTIGADOR AUXILIAR
- ESTACION EXPERIMENTAL DEL AUSTRO
- 連絡先
- DIRECTOR EJECUTIVO
- Av. Eloy Alfaro N30-350 y Av. Amazonas Edificio MAGAP – 4to. piso
- 022567645
地理的範囲
PICHINCHA
| 座標（緯度経度） | 南 西 [-90, -180], 北 東 [90, 180] |
|---|
生物分類学的範囲
N/A
| Kingdom | Plantae |
|---|---|
| Phylum | Tracheophyta |
| Class | Magnoliopsida |
| Order | Rosales |
| Family | Rosaceae |
時間的範囲
| 開始日 / 終了日 | 2020-10-20 / 2021-10-20 |
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プロジェクトデータ
El género Rubus está conformado aproximadamente 700 especies que incluyen moras y frambuesas. En el Ecuador el cultivo de estas especies se centra en la especie Rubus glaucus, siendo uno de los frutales de mayor potencial agronómico en el Ecuador. Las principales investigaciones sobre el género se han centrado en estudios fisicoquímicos, manejo agrícola y en menor medida en la caracterización molecular. Por tal razón, este trabajo aportó con datos de variabilidad genética de especies del genero Rubus presentes en la serranía del Ecuador. El estudio se inició con la extracción de ADN y con la selección de un set de primers microsatélites polimórficos, se empleó la metodología M13-tailing para las amplificaciones y el analizador de ADN LI- COR 4300s. Se caracterizaron un total de 135 accesiones de moras, cultivadas y silvestres con 20 marcadores microsatélites seleccionados. Se obtuvo un índice polimórfico promedio moderado (0,624), identificándose un total de 180 alelos, y una heterocigosis promedio observada de 0,434, representada en su mayoría por las especies silvestres analizadas. Los análisis de asignación realizados diferenciaron a R. glaucus, del resto de moras analizadas y una estructura genética intraespecífica en dos grupos genéticos (SP1 Y SP2). Finalmente se identificaron muestras duplicadas permitiendo minimizar réplicas de materiales genéticos en el banco de germoplasma. Adicionalmente los marcadores AFLPs diferenciaron a R. glaucus de otras especies del genero y distinguieron una estructuración genetica entre los cultivares de mora analizados
| タイトル | Análisis de la variabilidad genética de moras de valles andinos de Ecuador |
|---|---|
| 識別子 | MAAE-DNB-CM-2020-0141 |
| ファンデイング | INIAP, FONTAGRO |
プロジェクトに携わる要員:
- データ処理者
- データ処理者
収集方法
Se colectaron 300 mg de tejido foliar primordios en una bolsa hermética con 50 gr de sílica gel para cada accesion . Las muestras foliares secas se almacenaron en un desecador conforme a lo indicado en Morillo & Miño, 2011.
| Study Extent | Las muestras de Rubus de valles andinos del Ecuador fueron tomadas de la colección establecida en la Granja Experimental Tumbaco de INIAP, localizada en la provincia de PIchincha, Parroquia Tumbaco, Av. Interoceánica km. 15 y Eloy Alfaro. |
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Method step description:
- La extracción de ADN se realizó con el protocolo de Khanuja, et al., (1999) con modificaciones reportadas en Morillo & Miño (2011). Las muestras de ADN se cuantificaron en el espectrofotómetro EPOCH-TM (Biotek®) usando el programa GEN5 (BioTeK Instruments, 2011). Se verificó la concentración por absorbancia en 260 nm y su índice de pureza 260nm/280nm. Las concentraciones de las muestras ADN fueron ajustadas a 10 ng/μl. Se verificó la validez de las muestras de ADN con una amplificación. La PCR y visualización de fragmentos se realizó de acuerdo con Morillo y Miño 2011. Se verificó la amplificación de 30 marcadores microsatélites. Se seleccionaron 20 para el genotipado del material. Las imágenes generadas fueron analizadas el programa Saga GTX (Licor, Usa), y de la lectura se obtuvo la matriz de datos genotípicos.
コレクションデータ
| コレクション名 | Coleccion de ADN |
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| 標本保存方法 | Deep frozen |
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書誌情報の引用
- MORILLO E. & MIÑO G. 2011. Marcadores Moleculares en Biotecnología Agrícola: Manual de procedimientos y técnicas en INIAP. Manual técnico No. 91. Instituto Nacional Autónomo de Investigaciones Agropecuarias, Estación Experimental Santa Catalina. Quito. 121 p.